Redigerer Gasskromatografi–massespektrometri (avsnitt)

=== Elektron ionisering ===
[[Fil:Electron ionization GC-MS.png|miniatyr|Blokkdiagram for gasskromatografi ved bruk av elektronionisering for å samle massespekteret]]
Den klart vanligste og kanskje standardiserte formen for ionisering er elektronionisering (EI). Molekylene kommer inn i MS (kilden er en kvadrupol eller selve ionefellen i en ionfelle MS) hvor de bombarderes med frie elektroner som sendes ut fra en glødetråd, ikke ulikt glødetråden man vil finne i en standard [[lyspære]]. Elektronene bombarderer molekylene og får molekylet til å fragmentere på en karakteristisk og reproduserbar måte. Denne «harde ionisering»-teknikken resulterer i dannelsen av flere fragmenter med lavt [[Masse-til-ladningsforhold|masse-ladningsforhold]] (m/z) og få, om noen, molekyler som nærmer seg molekylmasseenheten. Hard ionisering betraktes av massespektrometrister som bruk av molekylær elektronbombardement, mens «myk ionisering» er ladet ved molekylær kollisjon med en innført gass. Det molekylære fragmenteringsmønsteret er avhengig av elektronenergien som påføres systemet, typisk 70 eV ([[elektronvolt]]). Bruken av 70 eV muliggjør sammenligning av genererte spektre med biblioteksspektre ved bruk av produsent-levert programvare eller programvare utviklet av [[National Institute of Standards and Technology|National Institute of Standards]] (NIST-USA). Spektralbibliotekssøk bruker matchende algoritmer som sannsynlighetsbasert matching<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Probability based matching of mass spectra. Rapid identification of specific compounds in mixtures|publikasjon=Organic Mass Spectrometry|doi=10.1002/oms.1210090710|url=http://doi.wiley.com/10.1002/oms.1210090710|dato=Juli 1974|fornavn=F. W.|etternavn=McLafferty|etternavn2=Hertel|fornavn2=R. H.|etternavn3=Villwock|fornavn3=R. D.|serie=7|språk=en|bind=9|sider=690–702|issn=0030-493X|besøksdato=2021-02-18}}</ref> og punktprodukt<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Optimization and testing of mass spectral library search algorithms for compound identification|publikasjon=Journal of the American Society for Mass Spectrometry|doi=10.1016/1044-0305(94)87009-8|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jasms.8b00613|dato=September 1994|fornavn=Stephen E.|etternavn=Stein|etternavn2=Scott|fornavn2=Donald R.|serie=9|språk=en|bind=5|sider=859–866|issn=1044-0305|besøksdato=2021-02-18}}</ref> matching som brukes med analysemetoder skrevet av mange metodestandardiseringsbyråer. Kilder til biblioteker inkluderer NIST,<ref>{{Kilde www|url=https://www.nist.gov/srd|tittel=Standard Reference Data|besøksdato=2021-02-18|dato=2012-12-12|etternavn=sherena.johnson@nist.gov|språk=en|verk=NIST}}</ref> Wiley,<ref>{{Kilde www|url=https://sciencesolutions.wiley.com/|tittel=Home|besøksdato=2021-02-18|språk=en-US|verk=Wiley Science Solutions}}</ref> AAFS,<ref>{{Kilde www|url=https://www.ualberta.ca/index.html|tittel=University of Alberta|besøksdato=2021-02-18|språk=en|verk=www.ualberta.ca}}</ref> og instrumentprodusenter.

==== Kald elektron ionisering ====
Den «harde ioniseringsprosessen» med elektronionisering kan mykgjøres ved avkjøling av molekylene før ioniseringen, noe som resulterer i massespektre som er rikere på informasjon.<ref name=":1">{{Kilde artikkel|tittel=Gas chromatography-mass spectrometry with supersonic molecular beams|publikasjon=Journal of Mass Spectrometry|doi=10.1002/jms.1380|url=http://doi.wiley.com/10.1002/jms.1380|dato=Februar 2008|fornavn=Aviv|etternavn=Amirav|etternavn2=Gordin|fornavn2=Alexander|etternavn3=Poliak|fornavn3=Marina|etternavn4=Fialkov|fornavn4=Alexander B.|serie=2|språk=en|bind=43|sider=141–163|besøksdato=2021-02-18}}</ref> I denne metoden kalt kald elektronionisering (kald-EI) går molekylene ut av GC-kolonnen, blandet med tilsatt heliumfyllingsgass og utvides til vakuum gjennom en spesialdesignet supersonisk dyse, og danner en supersonisk molekylstråle (SMB). Kollisjoner med gassen ved den ekspanderende supersoniske strålen reduserer den indre vibrasjonsenergien (og rotasjonsenergien) til analytmolekylene, og reduserer dermed graden av fragmentering forårsaket av elektronene under ioniseringsprosessen.<ref name=":1" /> Kald-EI massespektre er preget av et rikelig molekylært ion mens det vanlige fragmenteringsmønsteret blir beholdt, og dermed blir kald-EI massespektre kompatible med bibliotekssøkidentifikasjonsteknikker. De forbedrede molekylionene øker identifiseringssannsynlighetene for både kjente og ukjente forbindelser, forsterker isomere massespektrale effekter og muliggjør bruk av isotop overflodanalyse for å belyse elementære formler.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Isotope abundance analysis methods and software for improved sample identification with supersonic gas chromatography/mass spectrometry|publikasjon=Rapid Communications in Mass Spectrometry|doi=10.1002/rcm.2637|url=http://doi.wiley.com/10.1002/rcm.2637|dato=2006-09-15|fornavn=Tal|etternavn=Alon|etternavn2=Amirav|fornavn2=Aviv|serie=17|språk=en|bind=20|sider=2579–2588|issn=0951-4198|besøksdato=2021-02-18}}</ref>