Redigerer Sars-CoV-2 (avsnitt)

===Mutasjoner===
SARS-CoV-2 ser ut til å mutere hyppig. En studie fra [[Island]] fant 40 forskjellige varianter av viruset, der de fleste [[mutasjon]]ene var uten noen effekt.<ref name="forskning"/><ref>{{Cite web|url=https://www.information.dk/indland/2020/03/forskere-sporet-40-mutationer-coronavirus-alene-paa-island|title=Forskere har sporet 40 mutationer af coronavirus – alene på Island &#124; Information|accessdate=2020-05-13|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200512163256/https://www.information.dk/indland/2020/03/forskere-sporet-40-mutationer-coronavirus-alene-paa-island|url-status=live}}</ref> En person hadde både et virus fra Italia/Østerrike og en egen islandsk mutasjon, og bare den islandske mutasjonen smittet videre til andre.<ref name="island"/> Tidlig viste en kinesisk studie <ref>{{Cite Q|Q87072039}}</ref> at det fantes minst to varianter av SARS-CoV-2. Den mest smittsomme av de to kom til Europa, men selv om viruset endrer seg hver 14. dag, så er det små mutasjoner som ikke gjør at virusets egenskaper endrer seg. <ref name="forskning" /> Det var sommeren 2020 oppdaget egne mutasjoner av SARS-CoV-2 i Italia, Østerrike, Danmark, Storbritannia, USA og Island <ref name="island" /> og i USA var minst 14 mutasjoner oppdaget. <ref>{{Cite web|url=https://medicalxpress.com/news/2020-05-mutations-sars-cov-strain-easily.html|title=14 mutations found in SARS-CoV-2: One strain may be more easily spread|website=medicalxpress.com|accessdate=2020-05-13|archiveurl=https://web.archive.org/web/20200512224612/https://medicalxpress.com/news/2020-05-mutations-sars-cov-strain-easily.html|url-status=live}}</ref> En artikkel fra 21. februar 2020 viste at viruset hadde mutert 93 forskjellige steder på [[genom]]et.<ref>{{Cite Q|Q89858902}}</ref> 4. mai 2020 var det klart at mutasjoner har skjedd på minst 198 plasser i genomet. <ref>{{Cite Q|Q94590258}}</ref> Per oktober 2020 var to muterte varianter av viruset funnet i Norge. En variant (S477N) smittet flere på busstur og en variant fra Trondheim ([[N439K]]) antas å smitte mer og gi symptomer raskere. <ref>{{Kilde www|url=https://www.vg.no/i/Ky3xyX|tittel=Slik er de nye, muterte virusene|besøksdato=2020-10-22|språk=nb|verk=www.vg.no}}</ref> Metoden [[helgenomsekvensering]] brukes for å avdekke hvilken variant av viruset prøvene er fra.<ref>[https://www.fhi.no/nyheter/2021/fhi-styrker-kapasiteten-for-analyse-av-prover/ FHI styrker kapasiteten for analyse av prøver] {{Wayback|url=https://www.fhi.no/nyheter/2021/fhi-styrker-kapasiteten-for-analyse-av-prover/ |date=20210126221430 }}. Folkehelseinstituttet. Besøkt 27. januar 2021.</ref> I Danmark ble en variant som smittet mellom mink og mellom mink og mennesker (Y453F) funnet i november 2020. <ref>{{Kilde www|url=https://www.ssi.dk/aktuelt/nyheder/2021/status-for-smitte-med-minkvarianten-i-danmark|tittel=Status for smitte med minkvarianten i Danmark|besøksdato=2021-02-22|etternavn=name|språk=da|verk=www.ssi.dk}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Working paper on SARS-CoV-2 spike mutation arising in Danish mink, ..|publikasjon=ssi.dk|url=https://files.ssi.dk/Mink-cluster-5-short-report_AFO2|forfattere=Ria Lassaunière, Jannik Fonager, Thomas Bruun Rasmussen, Anders Fomsgaard}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Detection of new SARS-CoV-2 variants related to mink|publikasjon=ECDC|url=https://www.ecdc.europa.eu/sites/default/files/documents/RRA-SARS-CoV-2-in-mink-12-nov-2020.pdf|dato=12. november 2020}}</ref>

Allerede 5. mars 2020 ble det offentliggjort at viruset hadde mutert, og eksisterer i to utgaver, en S-versjon som gir milde symptomer, og en L-versjon som spres fortere og gjør folk mer syke. <ref>{{Kilde avis|tittel=Coronavirus has mutated into more aggressive disease, say scientists|url=https://www.telegraph.co.uk/science/2020/03/04/coronavirus-has-mutated-aggressive-disease-say-scientists/|avis=The Telegraph|dato=2020-03-04|besøksdato=2020-04-18|issn=0307-1235|språk=en-GB|fornavn=Sarah|etternavn=Knapton|arkiv-dato=2020-04-14|arkiv-url=https://web.archive.org/web/20200414123145/https://www.telegraph.co.uk/science/2020/03/04/coronavirus-has-mutated-aggressive-disease-say-scientists/|url-status=live}}</ref> Etter et år var flere mutasjoner oppdaget og fem varianter ble fulgt ekstra nøye, B.1.1.7 fra Storbritannia , [[B.1.351]] fra Sør-Afrika, [[SARS-CoV-2 Epsilon-varianten|B.1.427]] og [[B.1.429]] fra California, og P.1 fra Japan/Brasil. <ref name=":6"/> I desember 2020 ble en mutasjon senere kalt [[B.1.617]] identifisert i India. Denne mutasjonen er sannsynlig årsak til en kraftig smitteøkning i India i april 2021. <ref>{{Kilde www|url=https://www.worldometers.info/coronavirus/country/india/|tittel=India Coronavirus: 14,291,917 Cases and 174,335 Deaths - Worldometer|besøksdato=2021-04-16|språk=en|verk=www.worldometers.info}}</ref><ref>{{Kilde www|url=https://www.vg.no/i/qA466w|tittel=217.000 smittetilfeller på én dag i India: – Viruset vil alltid være smartere enn mennesket|besøksdato=2021-04-16|språk=nb|verk=www.vg.no}}</ref> I slutten av mai 2021 innførte WHO et navnesystem for mutasjoner basert på [[Det greske alfabetet|greske bokstaver]], for slik å unngå de uheldige effektene av at landet som først oppdager viruset får det navngitt etter seg.

* Koronavirusmutasjon Alfa,<ref name=":9"/> også kalt [[Lineage B.1.1.7]] eller 20I/501Y.V1 og [[VOC-202012/01]],<ref>{{Webbref|titel=Preliminary genomic characterisation of an emergent SARS-CoV-2 lineage in the UK defined by a novel set of spike mutations|url=https://virological.org/t/preliminary-genomic-characterisation-of-an-emergent-sars-cov-2-lineage-in-the-uk-defined-by-a-novel-set-of-spike-mutations/563|verk=Virological|datum=2020-12-18|hämtdatum=2020-12-21|språk=en-US}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Mutant coronavirus in the United Kingdom sets off alarms, but its importance remains unclear|url=https://www.sciencemag.org/news/2020/12/mutant-coronavirus-united-kingdom-sets-alarms-its-importance-remains-unclear|verk=Science {{!}} AAAS|datum=2020-12-20|hämtdatum=2020-12-21| språk=en|förnamn=Kai|efternamn=KupferschmidtDec. 20|efternamn2=2020|förnamn3=5:45|efternamn3=Pm}}</ref> ble oppdaget i [[Storbritannia]] i oktober 2020 fra en sekvensert virusprøve fra september,<ref>{{Kilde www|tittel=Covid: Nations impose UK travel bans over new variant|url=https://www.bbc.com/news/world-europe-55385768|utgiver=BBC News|dato=2020-12-20|besøksdato=2021-01-25|språk=en}}</ref> og begynte å spre seg bredt i midten av desember. Varianten syntes også å korrelere med den betydelige økningen av bekreftede sykdomstilfeller i [[England]]. Denne økningen antas delvis å skyldes at mutasjonen av N501Y inne i [[virusmembran]]ens proteiners reseptorbindende [[Domene (biologi)|domene]] som trenges for å bindes til [[Angiotensinkonverterende enzymer|ACE2]] hos menneskets celler. Den 21. januar 2021 ble varianten påvist i [[Nordre Follo]] kommune.<ref>[https://www.fhi.no/nyheter/2021/engelsk-virusvariant-pavist-i-utbrudd-i-nordre-follo/ Engelsk virusvariant påvist i utbrudd i Nordre Follo] {{Wayback|url=https://www.fhi.no/nyheter/2021/engelsk-virusvariant-pavist-i-utbrudd-i-nordre-follo/ |date=20210125112227 }} FHI. Besøkt 25. januar 2021.</ref> Varianten spres mer enn 50% fortere og kan gi et mer alvorlig forløp av covid-19. <ref>{{Cite Q|Q104794109}}</ref> I slutten av april 2021 var B.1.1.7-varianten dominerende i alle Norges fylker.<ref name=":8"/>

* Variant Beta,<ref name=":9" /> en mutasjon også kalt [[Variant 501.V2]], ble oppdaget i [[Sør-Afrika]] av landets folkehelsemyndighet den 18. desember 2020.<ref>{{cite web|rubrik=South Africa announces a new coronavirus variant.|url=https://www.nytimes.com/2020/12/19/world/south-africa-announces-a-new-coronavirus-variant.html|tidning=The New York Times|datum=2020-12-18|hämtdatum=2020-12-21|issn=0362-4331|språk=en-US|förnamn=Sheri|efternamn=Fink}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Ny mutation i Sydafrika – sprider sig snabbare|url=https://www.expressen.se/nyheter/ny-mutation-i-sydafrika-sprider-sig-snabbare/|verk=www.expressen.se|hämtdatum=2020-12-21|språk=sv}}</ref><ref>{{Webbref|titel=Muterat virus sprider sig i Sydafrika – liknar brittiskt|url=https://omni.se/muterat-virus-sprider-sig-i-sydafrika-liknar-brittiskt/a/39BWk0|verk=Omni|hämtdatum=2020-12-21|språk=sv}}</ref> Varianten forekommer først og fremst hos yngre mennesker uten underliggende sykdommer og fører til et mer alvorlig sykdomsforløp.<ref>{{Webbref| url=https://www.washingtonpost.com/world/africa/south-africa-coronavirus-second-wave/2020/12/18/d4a51aec-3ff7-11eb-b58b-1623f6267960_story.html|titel=South Africa’s second coronavirus wave is fueled by a new strain, teen ‘rage festivals’|hämtdatum=22. desember 2020|datum=18. desember 2020|utgivare=Washington Post}}</ref> Den sørafrikanske folkehelsemyndigheten indikerte også at denne varianten spres mye mer aggressivt enn tidligere varianter. Varianten inneholder flere mutasjoner som gjør at den lettere fester seg på menneskets celler, dette på grunn av tre mutasjoner inne i [[virusmembran]]ens proteiners reseptorbindende [[domene (biologi)|domene]] som trenges for å bindas til [[Angiotensinkonverterende enzymer|ACE2]] i menneskets celler.<ref>{{Webbref| titel=Full Presentation by SSAK - 18 Dec {{!}} Virus {{!}} Mutation|url=https://www.scribd.com/document/488618010/Full-Presentation-by-SSAK-18-Dec|verk=Scribd|hämtdatum=2020-12-21|språk=en}}</ref> Den 3. februar 2021 ble denne varianten påvist i [[Bergen]].<ref>[https://www.nrk.no/vestland/mutert-virus-pavist-av-helse-bergen-1.15357351 Mutert virus påvist av Helse Bergen]. NRK. Besøkt 4. februar 2021.</ref> Vaksinen til Johnson & Johnson viste seg å være mindre effektiv i Sør-Afrika enn andre steder, noe som antas å være fordi vaksine mot denne virusmutasjonen er mindre effektivt. <ref>{{Kilde www|url=https://www.standard.co.uk/news/world/johnson-johnson-singledose-vaccine-trial-b917930.html|tittel=Johnson & Johnson’s single-shot vaccine 66% effective in global trial|besøksdato=2021-03-17|dato=2021-01-29|fornavn=Michael|etternavn=Howie|språk=en|verk=www.standard.co.uk}}</ref> I april 2021 var viruset spredt lokalt i Viken, Nordland og Rogaland.<ref name=":8" />

* Variant Gamma,<ref name=":9" /> [[Lineage P.1]] ble oppdaget av Det nasjonale institutt for smittsomme sykdommer (NIID) i Japan den 6. januar 2021 i fire personer som var ankommet til [[Tokyo]] etter å ha besøkt delstaten [[Amazonas (Brasil)|Amazonas]] i Brasil fire dager tidligere.<ref name="IndyWWK"/><ref>{{cite news |author=<!--Staff writer(s)/no by-line.--> |title=Japan finds new coronavirus variant in travelers from Brazil |url=https://japantoday.com/category/national/corrected-update-3-japan-finds-new-coronavirus-variant-in-travellers-from-brazil |work=Japan Today |location=Japan |date=11. januar 2021 |access-date=2021-01-14}}</ref> Denne versjonen er vanskeligere å behandle og vaksinene er ikke like effektive. <ref name=":6" /> I april 2021 var viruset identifisert i Viken og Vestland.<ref name=":8" />
*Variant Delta,<ref name=":9" /> "dobbeltmutanten" B.1.617, som spredte seg raskt i India i første del av 2021, inneholder flere mutasjoner, blant annet [[P681R]], [[E484Q]] og [[L452R]]. <ref name=":7"/> E484Q ligner E484K-mutasjonen som har gjort den britiske mutasjonen mer smittsom, mens L452R har gjort at viruset i California lettere kommer inn i cellene.<ref>{{Kilde www|url=https://www.sciencemag.org/news/2021/02/coronavirus-strain-first-identified-california-may-be-more-infectious-and-cause-more|tittel=California coronavirus strain may be more infectious—and lethal|besøksdato=2021-05-07|dato=2021-02-23|fornavn=Meredith|etternavn=WadmanFeb. 23|etternavn2=2021|fornavn3=1:20|etternavn3=Pm|språk=en|verk=Science {{!}} AAAS}}</ref> Kombinasjonen ser ut til å gi en variant som er lettere å spre, som utvikler seg raskere og unngår antistoffer. <ref name=":7" /><ref>{{Kilde www|url=https://timesofindia.indiatimes.com/life-style/health-fitness/health-news/india-coronavirus-variant-what-makes-indias-double-mutant-covid-variant-b-1-617-so-concerning/articleshow/82029148.cms|tittel=Coronavirus: What makes India's double mutant COVID variant, B.1.617 so concerning? - Times of India|besøksdato=2021-04-16|språk=en|verk=The Times of India}}</ref> [[Bamlanivimab|Antistoffet bamlanivimab]] virker ikke mot B.1.617, ifølge en forhåndspublisering av en studie fra mai 2021. <ref>{{Cite Q|Q108223496}}</ref> Deltavarianten anslås å være dobbelt så smittsom som det opprinnelige SARS-CoV-2, og hver smittet kan smitte opp til 10 personer, og er like smittsomt som vannkopper. <ref>{{Kilde www|url=https://context-cdn.washingtonpost.com/notes/prod/default/documents/54f57708-a529-4a33-9a44-b66d719070d9/note/753667d6-8c61-495f-b669-5308f2827155.|tittel=Improving communications around vaccine breakthrough and vaccine effectiveness|besøksdato=18.08.2021|forfattere=cdc.gov|dato=29.07.2021|forlag=cdc.gov|sitat=Delta variant is as transmissible as: - Chicken Pox|arkiv-dato=2021-08-11|arkiv-url=https://web.archive.org/web/20210811184943/https://context-cdn.washingtonpost.com/notes/prod/default/documents/54f57708-a529-4a33-9a44-b66d719070d9/note/753667d6-8c61-495f-b669-5308f2827155.|url-status=yes}}</ref><ref>{{Kilde www|url=https://health-desk.org/articles/how-contagious-is-the-delta-variant-compared-to-other-infectious-diseases|tittel=How contagious is the Delta variant compared to other infectious diseases?|besøksdato=2021-08-18|språk=en|verk=health-desk.org}}</ref>
De fire første mutasjonene ble i mai 2021 klassifisert som bekymringsfulle, mens de neste fortløpende ble ansett som "interessante".<ref name=":9" />
* Variant Epsilon, mutasjonene B.1.427 og B.1.429 (20C/S:452R og 20C/S:452R), som ble oppdaget i California, både spres litt fortere (20%)<ref>{{Cite Q|Q107675413}}</ref> og vaksinene er litt mindre effektive. <ref name=":6" />
*Variant Zeta ble oppdaget i Brasil i april 2020 og klassifisert i mars 2021.
*Variant Eta ble funnet i flere land, bl.a. Nigeria og Storbritannia i desember 2020 og klassifisert i mars 2021.
*Variant Theta ble oppdaget på Filippinene i januar 2020, og klassifisert i mars 2021.
*Variant Iota ble oppdaget i USA i november 2020, og klassifisert i mars 2021.
*Variant Kappa ble oppdaget i India samtidig som variant Delta, og ble og klassifisert i april 2021. Denne varianten førte til spredning av [[Covid-19]] i delstaten Victoria i Australia tidlig i juni 2021.<ref>{{Kilde www|url=http://www.theguardian.com/australia-news/2021/jun/02/experts-dispute-victoria-claim-that-kappa-variant-is-more-infectious-than-previous-covid-outbreaks|tittel=Experts dispute Victoria claim that Kappa variant is more infectious than previous Covid outbreaks|besøksdato=2021-06-02|dato=2021-06-02|språk=en|verk=the Guardian}}</ref><ref>{{Kilde www|url=https://www.abc.net.au/news/2021-06-02/victoria-covid-cases-fleeting-transmission-strangers/100183460|tittel='They don't know each others' names': How is Victoria's outbreak being spread between strangers?|besøksdato=2021-06-02|dato=2021-06-02|språk=en-AU|verk=www.abc.net.au}}</ref>
*[[SARS-CoV-2 Lambda-varianten|Variant Lambda]] ble oppdaget i Peru i august 2020 og ble satt på WHOs overvåkingsliste 14. juni 2021. <ref>{{Kilde www|url=https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20210615_weekly_epi_update_44.pdf?sfvrsn=d45d71e2_5&download=true|tittel=COVID-19 Weekly Epidemiological Update|besøksdato=07.09.2021|forfattere=WHO|dato=15.06.2021}}</ref>
*[[SARS-CoV-2 My-varianten|Variant My]] ble oppdaget i Colombia i januar 2021 og ble satt på WHO's overvåkingsliste 30. august 2021.<ref>{{Kilde www|url=https://www.who.int/emergencies/emergency-health-kits/trauma-emergency-surgery-kit-who-tesk-2019/tracking-SARS-CoV-2-variants|tittel=Tracking SARS-CoV-2 variants|besøksdato=2021-09-07|språk=en|verk=www.who.int}}</ref>
*[[SARS-CoV-2 Omikron-varianten|Variant Omikron]] ble oppdaget i Sør-Afrika i november 2021 som B.1.1.529.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Heavily mutated coronavirus variant puts scientists on alert|publikasjon=Nature|doi=10.1038/d41586-021-03552-w|url=https://www.nature.com/articles/d41586-021-03552-w|dato=2021-11-25|fornavn=Ewen|etternavn=Callaway|språk=en|besøksdato=2021-11-26}}</ref><ref>{{Kilde www|url=https://www.nrk.no/norge/nakstad-meiner-ny-virusvariant-kan-utkonkurrere-delta-varianten-1.15746086|tittel=Nakstad meiner ny virusvariant kan utkonkurrere delta-varianten|besøksdato=2021-11-26|dato=2021-11-26|fornavn=Lena|etternavn=Jarstad|språk=nn-NO|verk=NRK}}</ref> Denne varianten har uvanlig mange mutasjoner<ref>{{Kilde www|url=https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern|tittel=Classification of Omicron (B.1.1.529): SARS-CoV-2 Variant of Concern|besøksdato=2021-11-29|språk=en|verk=www.who.int}}</ref> og smitter også vaksinerte.<ref name=":1"/> EU vurderte 2. desember 2021 risikoen som følge av omikron som høy til svært høy.<ref name=":1"/> 1. desember ble varianten også oppdaget i Norge.<ref>{{Kilde www|url=https://www.vg.no/i/G359om|tittel=Fire tilfeller av omikron påvist i Norge|besøksdato=2021-12-02|språk=nb|verk=www.vg.no}}</ref> FHI sa 13. desember 2021 at "Manglende handling nå kan gi store negative effekter for samfunnet, ikke bare for helsetjenestene i sykehus og kommuner." <ref>{{Kilde www|url=https://www.fhi.no/nyheter/2021/oppdatert-risikovurdering-omikronvarianten/|tittel=Oppdatert risikovurdering omikronvarianten|besøksdato=2021-12-14|etternavn=Publisert|språk=no|verk=Folkehelseinstituttet|arkiv-dato=2021-12-14|arkiv-url=https://web.archive.org/web/20211214012402/https://www.fhi.no/nyheter/2021/oppdatert-risikovurdering-omikronvarianten/|url-status=yes}}</ref> Fra 15. desember 2021 innførte regjeringen nye nasjonale tiltak for å begrense viruset. <ref>{{Kilde www|url=https://www.regjeringen.no/no/aktuelt/strengere-nasjonale-tiltak-for-a-begrense-smitten/id2892042/|tittel=Strengere nasjonale tiltak for å begrense smitten|besøksdato=2021-12-14|dato=2021-12-13|fornavn=Statsministerens|etternavn=kontor|språk=no|verk=Regjeringen.no}}</ref> I juni 2022 var Omikron BA.5 den klart dominerende varianten av coronavirus i Norge. <ref>{{Kilde www|url=https://www.fhi.no/nyheter/2022/risikovurdering-covid-19-ba.5/|tittel=Ny risikovurdering om covid-19|besøksdato=2022-07-04|etternavn=Publisert|språk=no|verk=Folkehelseinstituttet|arkiv-dato=2022-07-03|arkiv-url=https://web.archive.org/web/20220703174934/https://www.fhi.no/nyheter/2022/risikovurdering-covid-19-ba.5/|url-status=yes}}</ref> I 2023 var XBB.1.5 "Kraken" og EG.5 "Eris" de mest spredte. <ref>{{Kilde www|url=https://www.ecdc.europa.eu/en/news-events/ecdc-classifies-xbb15-lineages-amino-acid-change-f456l-variants-interest-following|tittel=ECDC classifies XBB.1.5-like lineages with the amino acid change F456L as variants of interest following an increase in SARS-CoV-2 transmission in EU/EEA countries and abroad|besøksdato=2023-08-18|dato=2023-08-17|språk=en|verk=www.ecdc.europa.eu}}</ref> Vinteren 2024 til 2025 var XEC den dominante varianten. <ref>https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/09122024_xec_ire.pdf</ref><ref>{{Kilde www|url=https://www.fhi.no/publ/statusrapporter/luftveisinfeksjoner/|tittel=Statusrapporter om covid-19, influensa og andre luftveisinfeksjoner|besøksdato=2025-03-24|dato=2020-04-22|språk=no|verk=Folkehelseinstituttet}}</ref> Denne vinteren ble den første uten en smittebølge.<ref>{{Kilde www|url=https://www.nrk.no/buskerud/fhi_-venter-koronabolge-pa-senvinteren-1.17189559|tittel=FHI: Venter koronabølge på senvinteren|besøksdato=2025-03-24|dato=2025-01-03|fornavn=Jan-Erik|etternavn=Wilthil|språk=nb-NO|verk=NRK}}</ref>