Redigerer Reinhard Heydrich (avsnitt)

====Germanisering====
I oktober 1941 kunngjorde Heydrich en ambisjon om fullstendig germanisering av protektoratet, og slo fast at mange tsjekkere måtte bli tyske slik at tsjekkernes nasjonale særpreg etterhvert ville forsvinne og smelte sammen med det tyske. Heydrich anslo at halvparten av tsjekkerne skulle bli tyske, resten skulle steriliseres eller fjernes. Han ville ha slutt på at personene selv kunne velge etnisitet, i stedet skulle såkalte raseeksperter ta beslutningen basert på objektive kjennetegn. Såkalte ''Kennkarte'' (legitimasjonskort) ble distribuert, og befolkningen ble ved hjelp av disse delt i «germaniserbare» og «ikke-germaniserbare» tsjekkere. Heydrichs kriterier for inndeling av befolkningen var uklare og førte til forvirring og tautrekking. Tidligere (april 1940) hadde tyske myndigheter bestemt at ekteskap mellom tsjekkere og etnisk krevde særskilt tillatelse. Under Neuraths styre ble i oktober 1940 ulike planer drøftet blant annet deportering av alle tsjekkere til et foreløpig ukjent sted og forflytning av omkring halvparten samtidig med assimilering av den gjenværende halvparten. Hitler foretrakk assimilering av omkring halvparte og høsten 1941 skisserte Heydrich etnisk rensing i tidligere uprøvd omfang.<ref name="Bryant"/>{{sfn|Gerwarth|2011|s=245-246}} Antropologen Karl Valentin Müller mente at tsjekkerne hadde en stor andel tysk blod som hadde blitt forurenset av slavisk blod; Müller anslo i rapport til Heydrich at 50 % av tsjekkerne hadde verdifullt tysk blod.{{sfn|Gerwarth|2011|s=250}}

[[Walter König-Beyer]],{{efn|I Bryants artikkel (2002) er han omtalt som Hans Joachim Beyer,<ref name="Bryant"/> mens Bryant i boken fra 2007 rettet navnet til Walther König-Beyer<ref>Bryant, C. (2007). ''Prague in black: Nazi rule and Czech nationalism.'' Harvard University Press, s. 126</ref> «Drawing on information from interwar conscription records, Dr. Walter König-Beyer wrote a forty-two-page report for Heydrich and top protectorate officials, affirming Frank and Neurath's claims that over half the Czech population could be assimilated. [...] König-Beyer, in fact, contended that the Czechs possessed more 'German blood' than did their Sudeten German rivals». Isabel Heinemann (2013) diskuterer Walter König-Beyers rapport.<ref>Heinemann (2013): ''Rasse, Siedlung, deutsches Blut. Das Rasse- und Siedlungshauptamt der SS und die rassenpolitische Neuordnung Europas'', Wallstein Verlag, s.176f</ref>}} [[antropolog]] i SS, undersøkte utseende og kroppsbygning hos tsjekkerne og konkluderte overraskende med at etniske tsjekkere i gjennomsnitt hadde mer «tyske» trekk enn sudettyskerne. De etnisk tyske i Tsjekkoslovakia bestred konklusjonen og hevdet at det var et spørsmål om personen var «verdig» å bli tysk (''Eindeutschungswürdigkeit'', «fortyskningsverdighet»), mens tyskere fra selve Tyskland mente at rasetrekk (''Eindeutschungsfähigkeit'', «fortyskningsevne») var avgjørende.<ref name="Bryant"/> Mange tyske antropologer antok at en god del av tsjekkerne hadde opphav i etnisk tyske som hadde blitt integrert i tsjekkisk kultur.<ref>Wendt, A. W. (2010). ''Eradicating Differences: The Treatment of Minorities in Nazi-Dominated Europe.'' Cambridge Scholars Publishing, s. 70.</ref> Beyer arbeidet i Heydrichs RSHA og kom til Praha som Heydrichs demografirådgiver. Beyer argumenterte for den østeuropeiske befolkningen skulle rangeres etter grad av genetisk tysk påvirkning. Heydrich gjorde Beyers og Müllers raseteorier til sine egne.{{sfn|Gerwarth|2011|s=250-251}} Det var en enorm oppgave å ordne hele den tsjekkiske befolkningen, flere millioner, i kategorier etter «germaniserbarhet». Heydrich mente at tyske trekk var lett gjenkjennelig i form av blå øyne, pen kroppsfasong og høyde samt ikke-fysiske egenskaper som rene hus, seksualmoral og atferd ellers. Tsjekkiske kvinner gift med etnisk tysk var forpliktet til å oppdra barna som tyske.{{sfn|Gerwarth|2011|s=252-253}} 

Heydrich iverksatte fordriving av tsjekkiske bønder og eksproprierte jorden for å gi plass til etnisk tyske bosettere fra blant annet Sudetenland, Bukovina og Transilvania. Planen var å bosette 150.000 etnisk tyske, men bare 6.000 bosettere ankom i løpet av okkupasjonen.{{sfn|Gerwarth|2011|s=254}}

Heydrich hevdet at mange etniske tsjekkere hadde meldt seg som tyske for å få større rasjoner og forlangte i april 1942 en revurdering av alle som hadde oppnådd tyske borgerskap. I februar 1942 kom han med nytt tiltak for germanisering: alle 17-18-år gamle tsjekkere skulle samles i leirer for rasetesting og gode kandidater skulle sendes til Tyskland for omskolering til tyske. Heydrich la opp til deportering av rasemessig uønskede tsjekkere. Heydrich så for seg at omtrent halvparten av tsjekkerne, jødene ikke medregnet, til slutt ville være germanisert.{{sfn|Gerwarth|2011|s=255-256}} I mai 1942 rapporterte Heydrich til Berlin at arbeidet med å sortere ut tsjekkere for germanisering var i gang. Under dekke av å foreta [[tuberkulose]]undersøkelser, begynte raseeksperter kartleggingen. Arbeidet stanset etter attentatet mot Heydrich 27. mai 1942, det tyske [[slaget om Stalingrad|nederlaget ved Stalingrad]] og oppblomstring av tsjekkisk [[patriot]]isme.<ref name="Bryant" />

Avdeling IV i riksprotektorens administrasjon hadde til oppgave å koordinere kulturlivet med sikte på å skape velvilje for tysk kultur. Tsjekkisk språk skulle begrenses til privatlivet før det ville forsvinne. Heydrich forlangte høsten 1941 at president [[Emil Hácha]] anerkjente protektoratet som del av det tyske riket og Hácha overrakte Heydrich de symbolske 7 nøklene til kronjuvelene. Heydrich ga ordre om undervisning i tsjekkisk historie skulle erstattes av tysk. [[Karlsuniversitetet]] ble stengt i 1939 og det tyske universitet i Praha, helt dominert av nazister, var det eneste i byen. Sammen med [[Albert Speer]] begynte han i desember 1941 å skisser omdanning av Praha til en tysk by.{{sfn|Gerwarth|2011|s=263-268}}