Redigerer
MALDI
(avsnitt)
Hopp til navigering
Hopp til søk
Advarsel:
Du er ikke innlogget. IP-adressen din vil bli vist offentlig om du redigerer. Hvis du
logger inn
eller
oppretter en konto
vil redigeringene dine tilskrives brukernavnet ditt, og du vil få flere andre fordeler.
Antispamsjekk.
Ikke
fyll inn dette feltet!
== Instrumentelt == [[Fil:MALDI TOF EN.png|miniatyr|Diagram over et MALDI [[Flyvetidsmassespektrometri|TOF]]-instrument. Prøvematrisen ioniseres av strålingsenergi som kommer ut fra overflaten. Prøven går inn i masseanalysatoren og blir i hovedsak oppdaget.]] Det er flere varianter av MALDI-teknologien, og sammenlignbare instrumenter produseres i dag for veldig forskjellige formål. Fra mer akademisk og analytisk, til mer industriell med høy gjennomstrømning. Massespektrometerfeltet har utvidet seg til å kreve massespektrometri med ultrahøy oppløsning, slik som FT-ICR-instrumentene<ref>{{Kilde www|url=http://www.biocompare.com/Editorial-Articles/41589-Talking-About-a-Revolution-FT-ICR-Mass-Spectrometry-Offers-High-Resolution-and-Mass-Accuracy-for-Pr/|tittel=Talking About a Revolution: FT-ICR Mass Spectrometry Offers High Resolution and Mass Accuracy for Pr|besøksdato=2021-03-11|språk=en|verk=www.biocompare.com}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Ultrahigh resolution mass spectrometry|publikasjon=Analytical and Bioanalytical Chemistry|doi=10.1007/s00216-007-1589-0|url=https://doi.org/10.1007/s00216-007-1589-0|dato=2007-11-01|fornavn=Philippe|etternavn=Schmitt-Kopplin|etternavn2=Hertkorn|fornavn2=Norbert|serie=5|språk=en|bind=389|sider=1309–1310|issn=1618-2650|pmc=PMC2129108|besøksdato=2021-03-11}}</ref>, samt flere instrumenter med høy gjennomstrømning.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Evaluation of MALDI-TOF MS as a tool for high-throughput dereplication|publikasjon=Journal of Microbiological Methods|doi=10.1016/j.mimet.2011.06.004|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0167701211002181|dato=September 2011|fornavn=Jonas|etternavn=Ghyselinck|etternavn2=Van Hoorde|fornavn2=Koenraad|etternavn3=Hoste|fornavn3=Bart|etternavn4=Heylen|fornavn4=Kim|etternavn5=De Vos|fornavn5=Paul|serie=3|språk=en|bind=86|sider=327–336|besøksdato=2021-03-11}}</ref> Ettersom mange MALDI MS-instrumenter kan kjøpes med en utskiftbar ioniseringskilde ([[Elektronsprayionisering|elektrosprayionisering]], MALDI, [[Atmosfærisk trykk kjemisk ionisering|ionisering ved atmosfæretrykk]] osv.) Overlapper teknologiene ofte og mange ganger kan enhver myk ioniseringsmetode potensielt brukes. For flere variasjoner av myke ioniseringsmetoder, se: [[Ionekilde]]. === Laser === MALDI-teknikker bruker vanligvis UV-lasere som nitrogenlasere (337 nm) og frekvens-tredoblet og firdoblet Nd:YAG-lasere (henholdsvis 355 nm og 266 nm).<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Recent methodological advances in MALDI mass spectrometry|publikasjon=Analytical and Bioanalytical Chemistry|doi=10.1007/s00216-014-7646-6|url=http://link.springer.com/10.1007/s00216-014-7646-6|dato=April 2014|fornavn=Klaus|etternavn=Dreisewerd|serie=9-10|språk=en|bind=406|sider=2261–2278|issn=1618-2642|besøksdato=2021-03-11}}</ref> Infrarøde laserbølgelengder brukt til infrarød MALDI inkluderer 2,94 μm Er:YAG-laser, midt-IR optisk parametrisk oscillator og 10,6 μm karbondioksidlaser. Selv om det ikke er så vanlig, brukes infrarøde lasere på grunn av deres mykere ioniseringsmåte.<ref>{{Kilde bok|url=https://www.worldcat.org/oclc/55939535|tittel=The encyclopedia of mass spectrometry|dato=2003|utgiver=Elsevier|isbn=978-0-08-043850-4|utgave=1st ed|utgivelsessted=Amsterdam|kapittel=6|oclc=55939535}}</ref> IR-MALDI har også fordelen av større materialfjerning (nyttig for biologiske prøver), mindre forstyrrelser med lav masse og kompatibilitet med andre matrisefrie laserdesorpsjonsmassespektrometri-metoder. === Flyvetid === [[Fil:MALDI Target.jpg|miniatyr|Prøvemål for et MALDI massespektrometer]] Typen av et massespektrometer som er mest brukt med MALDI, er [[Flyvetidsmassespektrometri|flyvetidsmassespektrometeret]] (TOF), hovedsakelig på grunn av dets store masseområde. TOF-måleprosedyren er også ideell for MALDI-ioniseringsprosessen, siden den pulserende laseren tar individuelle "skudd" i stedet for å jobbe kontinuerlig. MALDI-TOF-instrumenter er ofte utstyrt med en reflektron (et "ionespeil") som reflekterer ioner ved hjelp av et [[elektrisk felt]]. Dette øker ioneflyvebanen, og øker dermed flytid mellom ioner med forskjellig [[Masse-til-ladningsforhold|m/z]] og øker oppløsningen. Moderne kommersielle reflektron TOF-instrumenter når en oppløsningseffekt m/Δm på 50 000 FWHM (halvbredde i full bredde, Δm definert som toppbredde ved 50% av topphøyde) eller mer.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=High Resolution Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac203191t|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac203191t|dato=2012-01-17|fornavn=Feng|etternavn=Xian|etternavn2=Hendrickson|fornavn2=Christopher L.|etternavn3=Marshall|fornavn3=Alan G.|serie=2|språk=en|bind=84|sider=708–719|issn=0003-2700|besøksdato=2021-03-11}}</ref> MALDI har blitt koblet til IMS-TOF MS for å identifisere fosforylering og ikke-fosforylering peptider.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Analysis of Phosphorylated Peptides by Ion Mobility-Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac0498009|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac0498009|dato=November 2004|fornavn=Brandon T.|etternavn=Ruotolo|etternavn2=Gillig|fornavn2=Kent J.|etternavn3=Woods|fornavn3=Amina S.|etternavn4=Egan|fornavn4=Thomas F.|etternavn5=Ugarov|fornavn5=Michael V.|etternavn6=Schultz|fornavn6=J. Albert|etternavn7=Russell|fornavn7=David H.|serie=22|språk=en|bind=76|sider=6727–6733|issn=0003-2700|besøksdato=2021-03-11}}</ref><ref>{{Kilde artikkel|tittel=Distinguishing between Phosphorylated and Nonphosphorylated Peptides with Ion Mobility−Mass Spectrometry|publikasjon=Journal of Proteome Research|doi=10.1021/pr025516r|url=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/pr025516r|dato=August 2002|fornavn=Brandon T.|etternavn=Ruotolo|etternavn2=Verbeck|etternavn3=Thomson|fornavn3=Lisa M.|etternavn4=Woods|fornavn4=Amina S.|etternavn5=Gillig|fornavn5=Kent J.|etternavn6=Russell|fornavn6=David H.|serie=4|språk=en|bind=1|sider=303–306|issn=1535-3893|besøksdato=2021-03-11}}</ref> MALDI-[[Fourier-transform ion syklotron resonans|FT-ICR]] MS har vist seg å være en nyttig teknikk der høyoppløselige MALDI-MS målinger er ønsket.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Ultrahigh-resolution matrix-assisted laser desorption/ionization Fourier transform ion cyclotron resonance mass spectra of peptides|publikasjon=Journal of Mass Spectrometry|doi=10.1002/jms.1190300607|url=http://doi.wiley.com/10.1002/jms.1190300607|dato=Juni 1995|fornavn=Ljiljana|etternavn=Paša-Tolić|etternavn2=Huang|fornavn2=Yulin|etternavn3=Guan|fornavn3=Shenheng|etternavn4=Kim|fornavn4=Hyun Sik|etternavn5=Marshall|fornavn5=Alan G.|serie=6|språk=en|bind=30|sider=825–833|issn=1076-5174|besøksdato=2021-03-11}}</ref> === Atmosfærisk trykk === Atmosfærisk trykk (AP) matriksassistert laserdesorpsjon/ioniserings (MALDI) er en ioniseringsteknikk (ionekilde) som i motsetning til vakuum MALDI opererer i normalt atmosfærisk miljø.<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Atmospheric Pressure Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac990998k|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac990998k|dato=Februar 2000|fornavn=Victor V.|etternavn=Laiko|etternavn2=Baldwin|fornavn2=Michael A.|etternavn3=Burlingame|fornavn3=Alma L.|serie=4|språk=en|bind=72|sider=652–657|issn=0003-2700|besøksdato=2021-03-11}}</ref> Hovedforskjellen mellom vakuum MALDI og AP-MALDI er trykket der ionene dannes. I vakuum MALDI produseres ioner vanligvis ved 10 mTorr eller mindre mens AP-MALDI-ioner dannes i [[atmosfærisk trykk]]. Tidligere har den største ulempen med AP-MALDI-teknikken sammenlignet med konvensjonelt vakuum MALDI vært den begrensede følsomheten; Imidlertid kan ioner overføres til massespektrometeret med høy effektivitet og deteksjonsgrenser for attomol er rapportert.<ref>{{Kilde www|url=http://apmaldi.com/main/|tittel=MassTech – Your Source for AP-MALDI|besøksdato=2021-03-11|språk=en-US}}</ref> AP-MALDI brukes i massespektrometri (MS) i en rekke applikasjoner som spenner fra [[proteomikk]] til [[medikament]]<nowiki/>oppdagelse. Populære emner som tas opp av AP-MALDI massespektrometri inkluderer: proteomikk; masseanalyse av [[DNA]], [[RNA]], PNA, [[lipid]]er, [[oligosakkarid]]er, fosfopeptider, [[bakterier]], små molekyler og syntetiske [[polymer]]er, lignende anvendelser som også tilgjengelige for vakuum MALDI-instrumenter. AP-MALDI-ionekilden kan enkelt kobles til et [[ionefelle]]<nowiki/>massespektrometer<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Atmospheric Pressure MALDI/Ion Trap Mass Spectrometry|publikasjon=Analytical Chemistry|doi=10.1021/ac000530d|url=https://pubs.acs.org/doi/10.1021/ac000530d|dato=November 2000|fornavn=Victor V.|etternavn=Laiko|etternavn2=Moyer|fornavn2=Susanne C.|etternavn3=Cotter|fornavn3=Robert J.|serie=21|språk=en|bind=72|sider=5239–5243|issn=0003-2700|besøksdato=2021-03-11}}</ref> eller et hvilket som helst annet MS-system utstyrt med [[Elektronsprayionisering|elektrosprayionisering]] (ESI) eller nanoESI-kilde. === Aerosol === I aerosolmassespektrometri består en av ioniseringsteknikkene i å skyte en laser mot individuelle dråper. Disse systemene kalles single particle mass spectrometers (SPMS).<ref>{{Kilde artikkel|tittel=Real-time chemical characterization of atmospheric particulate matter in China: A review|publikasjon=Atmospheric Environment|doi=10.1016/j.atmosenv.2017.02.027|url=https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S1352231017301073|dato=Juni 2017|fornavn=Yong Jie|etternavn=Li|etternavn2=Sun|fornavn2=Yele|etternavn3=Zhang|fornavn3=Qi|etternavn4=Li|fornavn4=Xue|etternavn5=Li|fornavn5=Mei|etternavn6=Zhou|fornavn6=Zhen|etternavn7=Chan|fornavn7=Chak K.|språk=en|bind=158|sider=270–304|besøksdato=2021-03-11}}</ref> Prøven kan eventuelt blandes med en MALDI-matrise før aerosolisering.
Redigeringsforklaring:
Merk at alle bidrag til Wikisida.no anses som frigitt under Creative Commons Navngivelse-DelPåSammeVilkår (se
Wikisida.no:Opphavsrett
for detaljer). Om du ikke vil at ditt materiale skal kunne redigeres og distribueres fritt må du ikke lagre det her.
Du lover oss også at du har skrevet teksten selv, eller kopiert den fra en kilde i offentlig eie eller en annen fri ressurs.
Ikke lagre opphavsrettsbeskyttet materiale uten tillatelse!
Avbryt
Redigeringshjelp
(åpnes i et nytt vindu)
Denne siden er medlem av 2 skjulte kategorier:
Kategori:CS1-vedlikehold: Ekstra tekst
Kategori:CS1-vedlikehold: PMC-format
Navigasjonsmeny
Personlige verktøy
Ikke logget inn
Brukerdiskusjon
Bidrag
Opprett konto
Logg inn
Navnerom
Side
Diskusjon
norsk bokmål
Visninger
Les
Rediger
Rediger kilde
Vis historikk
Mer
Navigasjon
Forside
Siste endringer
Tilfeldig side
Hjelp til MediaWiki
Verktøy
Lenker hit
Relaterte endringer
Spesialsider
Sideinformasjon